朱宸濠在南昌等着王守仁来攻，等到七月初还没有动静，便率军北上。
然而，在安庆城下，朱宸濠的叛军队伍很快被教导做人。整整十八天的围攻，除了不断地损兵折将，什么战果都没取得。
七月十五日，朱宸濠望着依然坚挺的安庆城，再瞧瞧已经散去不少的军队，只得下令撤军返回南昌。回师途中物议纷纷，离队者几半。
此时，南赣的王阳明已经整合好手底下的杂牌军后，挥师北上，七月二十日，攻下南昌城。
二十三日，朱宸濠率军抵达为南昌城北三四十里的樵舍，当夜南昌知府郑瓛乘机逃回，将叛军内情告知驻扎在左近的吉安知府伍文定。
伍文定率部连夜挺进，袁州知府徐琏、瑞州通判胡尧元等纷纷跟上。
二十六日黎明，伍文定利用募集的四十艘船，借助风势，从下游发动火攻，明军随之杀入。
遭受水陆夹击的叛军，仓促之间根本无法抵御，被明军杀得溃不成军。
正在召集其群臣开会的朱宸濠，眼见火势冲天，连自己的副舟都被焚毁，自知大势已去，遂换船出逃，结果被万安知县所获。
随军行动的宁藩宗室，及李士实、刘养正、王纶等皆就擒。
宁王妃娄氏投水自尽。
宁王朱宸濠之乱，从起事至失败，仅仅历时42天，可谓是其兴也勃，其亡也忽。】他本人在败亡的当日被废为庶人，次年十二月，在通州被赐死。
可以说朱宸濠在这次叛乱中，除了留下一地骂名，什么都没获得，反倒是成就了王阳明善战之名。
七月十三日，朝廷接到南京守备参赞等官的奏报，才知晓朱宸濠已经起兵谋反。
就在朝臣对此议论纷纷之时，正德帝见猎心喜，提出要御驾亲征，不出意外的遭到几乎全体朝臣的反对。
皇帝不能亲征，将军总可以领兵征讨了吧。
于是乎镇国公朱寿紧急上线。
在群臣的反对下，总督军务、威武大将军、总兵官、后军都督府、太师、镇国公朱寿朱大将军，领受皇命领军征讨逆藩。
正德帝亲征，命张永率边兵两千人为前锋。
但大军未到，而提督南赣汀漳军务的副都御史王守仁已经擒获朱宸濠，正把他押送京师。
张永在途中拦住了王守仁，让他把朱宸濠放到鄱阳湖。
王守仁不答应，亲自到杭州见张永，张永不肯相见。
王守仁叱开了守门者，直闯入内，大呼“我是王守仁，来和你商议公事，为什么不见？”
张永被他的气势镇住，只好走出来。
王守仁于是对张永说：“江西已经遭战乱，损失很大，大部队到来，恐怕会出乱子。”
张永这才说道：“我来只是为了保护皇上，并非要抢功。”
并指着囚着朱宸濠的槛车说：“这要归我。”
王守仁立即把槛车给了他，并和张永一同返江西。
这时太监张忠等已经到了南昌，正在以追查朱宸濠余党为名，大肆骚扰地方。
张永到后安抚了地方，盘查了仓库，搜得了朱宸濠和吏部尚书陆完勾结的罪证，并催张忠和自己一同回京。
正德十四年八月二十二日，朱厚照率领大军从北京出发。
按惯例出师是不能带内眷的，正德帝和他宠爱的刘娘娘相约在潞河会面。刘娘娘相赠一簪，以为信物。
孰料正德帝纵马过卢沟桥时把簪子颠掉了，遂按兵不行，大索三日不得。
军至临清，依约派中使去接刘娘娘，但刘娘娘不见信簪，辞谢说：“不见簪，不信，不敢赴。”
正德帝见美人心切，没有办法，便独自乘舸昼夜兼行，亲自迎接美人。
正德十四年十二月，正德帝到了扬州府。
江南的一众官员如临大敌。
史书把正德帝的南巡描述为寻花问柳之旅。
太监吴经至扬选民居壮丽者改为提督府，将驻跸焉。经矫上意，刷处女寡妇，民间汹汹，有女者一夕皆适人，乘夜争门逃匿不可禁。
知府蒋瑶诣经恳免。
太监吴经大怒道：“汝小官敢尔汝头顾欲斫邪？”
瑶不为动，慢慢说道：“小官苟逆上意，自分必死，但百姓者朝廷之百姓，倘激生他变，恐将来责有所归。”
太监吴经大怒离去。
太监吴经密觇知寡妇及娼者家，夜半忽遣骑卒数人开城门，传呼驾至，令通衢燃炬光如白日。
太监吴经遍入其家捽诸妇以出，有匿者破垣毁屋必得乃已无一脱者。
哭声震动远近，寻以诸妇分送尼寺寄住。
有二人愤恚不食死。
知府蒋瑶为具棺殓之。
自是诸妇家皆以金赎乃得归，贫者悉收入总督府。
为了把正德帝这尊大佛请回京城，内阁阁老梁储蒋冕等力劝正德帝回京，并以正月南郊祭祀为由想把正德帝劝回来。
正德帝哪里听劝？只说要在南京举行祭祀。
正德帝在江南一呆八个多月，对江南情况摸透之后，才返程回京。
回程路上，武宗游镇江，登金山，自瓜洲过长江。
正德十五年九月，经清江浦，正德帝见水上风景优美，鱼翔浅底，顿起渔夫之兴，便自驾小船捕鱼玩耍。
结果，提网时见鱼多，正德帝大乐，尽力拖拉，使船体失去平衡，他本人也跌落水中。
正德帝在北京长大，不懂游水，入水后手忙脚乱，一阵乱扑腾，亲侍们虽然把他救起，但水呛入肺，加之惶恐惊悸，身体便每况愈下了。
也可能他是受惊之后，加上秋日着凉，引发了肺炎。
正德十六年正月，武宗一行才回到北京。
正月十四日，正德帝仍旧强撑，在南郊主持大祀礼。
行初献礼时，武宗皇帝下拜天地，忽然口吐鲜血，瘫倒在地，再也爬不起来了。
大礼不得不终止。
三月十四日，武正德帝已处于弥留状态，他对司礼监太监说：“朕疾不可为矣。其以朕意达皇太后，天下事重，与阁臣审处之。前事皆由朕误，非汝曹所能预也。”言毕崩驾于豹房，时年三十一岁。
皇太后张氏与首辅杨廷和稳定京中局势，因正德帝无子继位，按照“兄终弟及”的祖训，时年14岁的兴王世子朱厚熜承统，年号嘉靖。