小智三人在真新镇休息的时候突然接到了大木博士的通知，期间小月还去考了宝可梦饲育家的考核并且通过了，让三人来大木研究所一趟，有事拜托他们。
小智三人听到之后就前往大木研究所了，来到大木研究所之后三人先是找到了大木博士。
“大木博士我们来了，你说有事找我们帮忙是什么事啊。”小智来到大木博士的面前之后询问道。
“是这样的，橘子群岛的内木博士最近发现了一颗特殊的精灵球我想让你们去帮我取一下。”大木博士说明了一下叫小智等人来此的目的道。
“特殊的精灵球？？不能用传送装置直接传送回来吗？？”小月有些不解的问道。
“不行！！我和内幕博士已经试过好几次了都失败了，小火这个人我不放心，小茂自从庆功宴输给小智就跑去成都地区了只能找你们了。”大木博士摇了摇头有些无奈的说道。
“原来是这样啊，那我们就去吧小智。”小月听到大木博士的解释之后对着小智说道。
“好啊，我听说橘子群岛也有不少关东的旅游圣地，还有着橘子联盟，大木博士我要去参加那边的橘子联盟再帮你带回来。”小智直接答应了小月的请求对着大木博士说道。
“可以，那就麻烦你了小智。”大木博士听到小智的话直接同意了。
四人又聊了一会儿之后就回到了小智的家里，在吃饭的时候小智和花子说明了一下大木博士的委托，花子直接同意了。
吃完饭之后小月也回家和自己的父母说明了情况，不出意外的小月的父母都是直接同意了。
小智三人在休息了一天之后就前往小智早已定好的飞机票的飞机场了，三人坐着飞机顺利的抵达了橘子群岛的岱柑岛。
小智三人先是来到了岱柑岛的宝可梦中心休息了一会儿之后，根据洛托姆手机的指引来到了内木博士的研究所。
“你们好，请问内木博士在吗？？我是大木博士派来取特殊的精灵球的。”小智来到研究所的大门前按响了门铃说道。
“等一下，我们马上就来。。。啊！！！”对面接通之后刚说了一句之后就不知道为什么发出一声惊叫然后电话就被挂断了。
小智三人听到尖叫声和门没关，立马打开门朝着里面跑去，跑进去之后看到三明女性正在收拾着地上的衣物。
再加上周围散落的衣物和周围的各种食品的包装袋，小智三人猜到了大致情况，应该是她们踩到衣物滑到了，滑到的期间不小心挂断的电话。
小刚和小月见状帮着三人收拾起了散落在周围的衣物，两人很快的就帮助这些研究员收拾好了散落的衣物和食品包装袋。
“太谢谢你们了，我们平时都忙于研究根本没时间收拾，对了你们是来找内木博士拿特殊精灵球的是吧，
内木博士现在应该在海边照顾宝可梦，我带你们去找她吧。”三名研究员看着周围被小月和小刚收拾干净的环境对着小智三人感谢了一下后说道。
随后小智三人和三名研究人员来到了海边，见到了在海边给宝可梦们喂食的内木博士。
“内木博士你好，我是来帮大木博士来拿特殊精灵球的小智。”小智看到内木博士喂好野生宝可梦了之后上前打招呼道。
“哦！！美丽。。。。疼疼疼。”小刚看到内木博士就要上前搭讪就被小月给拽着耳朵拉走了。
“不会好意思，我刚刚在喂野生宝可梦，让你们久等了，跟我来吧，我带你们去拿。”内木博士看到小刚的情况一时有点不知道该说什么，但是很快就反应过来了说道。
随后小智三人在内木博士和她的三名助手来到了研究所之内，来到一个机器前，内木博士打开了机器从机器里面拿出一颗金银相间的精灵球。
“这就是我和大木博士说的特殊的精灵球了，因为精灵球上这两个字母很像GS所以我把它命名为GS球。”内木博士手拿着金银相间的精灵球说道。
“这个精灵球？？内木博士给我看一下GS球，这个精灵球我好像在哪看过。”小智看到内木博士手上的GS球有些熟悉感说道。
“小智你知道这个精灵球？？”内木博士听到小智的话之后将GS球交给了小智说道。
“果然是这个，这个精灵球我在一座上古遗迹看到过，是使用凤王和洛奇亚的羽毛做成的，可以封锁时空，
是专门捕捉时拉比的精灵球。”小智对比了一下以前用幻月保存的遗迹内壁画上的精灵球说道。
“原来如此，难怪无法传送也无法拆解。”内木博士听到小智的话之后恍然大悟的说道。
“拆解你们之前还拆解过GS球啊。”小月听到内木博士的话之后有些惊讶说道。
“是啊，我们当时用电钻钻过，电锯锯过，还有很多的办法不过最终都失败了。”内木博士说了一下获得GS球之后的情况。
“那这个GS球就交给我吧。”小智尝试了一下，GS球也可以正常缩小后收到自己的背包里面了。
之后小智等人和内木博士又聊了了一会儿就离开了，不过离开的只有小智和小月两人，小刚执意要留下来，小智和小月没办法就随了他的意愿了。
“给我住手，放开那只拉普拉斯。”小智和小月走在前往宝可梦中心的路上的时候看到前方一群小混混在欺负一只搁浅了的拉普拉斯说道。
不过那群小混混只是看了小智和小月一眼就继续的让自己的宝可梦欺负拉普拉斯了。
“皮卡丘使用十万伏特。”小智见状对着肩膀上的皮卡丘说道。
皮卡丘从小智的肩膀上跳了下来，身上释放出了一道强力的电流朝着小混混和他们的宝可梦打去。
皮卡丘的十万伏特将小混混电的之颤，电流消失之后准备指挥宝可梦反击的小混混们看到失去战斗能力的宝可梦们放了一句狠话就离开了。
小智来道拉普拉斯的身前先是将拉普拉斯收服了之后，和小月来到了自己的空间的海边将拉普拉斯放了出来。
让沙奈朵帮拉普拉斯治疗好，然后再次将拉普拉斯带到外面准备将其放生但是被拉普拉斯拒绝了，就这样小智成功的收服了拉普拉斯。