黄巢逃出长安，派大将孟楷率领一万人做先锋，攻打蔡州（河南驻马店市汝南县），节度使秦宗权力战不敌降于黄巢。
当初黄巢还在长安时，忠武军所辖陈州（今河南周口境）刺史赵犨，就预判黄巢一旦失败必会向东逃窜。因此，他提前修缮城防，征募士卒，储备粮草，以备不虞。
事态发展果然不出所料，孟楷攻陷蔡州扣随即转攻陈州，屯驻于项城（今河南项城县）。
赵犨先行示弱，做出一副要投降的样子。趁孟楷放松警惕之际，突然发起攻击，全歼孟楷所部，并生擒孟楷斩首示众。
孟楷能征善战，在义军中地位很高，是黄巢的左膀右臂。黄巢听到他战死的消息，既惊且怒。
六月，黄巢与秦宗权合兵一处包围陈州。义军沿陈州城墙挖掘了五道堑壕，兵分数路猛攻不止。
赵犨大义凛然的告诉城中军民：“我忠武军向来以义勇着称，陈州兵尤其精锐。我家世代享受朝廷优待，我发誓与陈州共存亡！大丈夫当视死如归，更何况为国捐躯不比投敌卖国苟活于世强吗！从今天起，大家与我一道杀贼。有敢说降敌者，定斩不赦！”
之后，赵犨数次率军出城与义军死战，多次击退义军。黄巢久攻不下愈发愤怒，停下逃亡的步伐，在陈州以北扎下大营，设置文武百官，准备长久作战。
此时的陈州境内早已寻不出一粒粮食，为求活命，义军制作了数百个巨大石磨，把抓来的流民活活扔进石磨碾碎，和着骨血生吃，如同禽兽一般，还美其名曰“舂磨寨”。他们以陈州为据点四处掳掠，河南、山东数十州惨遭荼毒。
起义到了这一阶段，所谓“义军”已经不能再冠以“义”字，纯粹就是一帮有组织的、失去人性的暴徒！
陈州战火纷飞生灵涂炭，朝廷各派势力却各忙各的没人关注。
七月初三，宣武军节度使朱温按照之前约定，率领数百近卫前往汴州上任。
战乱以来，宣武军所辖汴、宋（今河南商丘）二州连年饥荒，府库财物早已耗尽，百姓穷困潦倒。面临着内有骄兵难制、外被大敌所攻，几乎无日不战的恶劣局面，民心士气极为低迷。
辗转各地多年的朱温浑不介意，他似乎在这里找到了人生的方向，整日里斗志昂扬、干劲十足。
说起来汴州军民得感谢他，自唐以后，长安、洛阳因屡被战火摧残损毁严重，失去了成为帝都的基本条件。而汴州却在朱温精心打理下蓬勃发展，最终成为日后北宋的国都所在。
李克用率军返归雁门。途中，朝廷诏令他为河东节度使，征召原节度使唤郑从谠回朝任职，李克用遂得以占据太原（河东治所）。后来，他儿子李存勖以此为根基，消灭后梁统一北方，建立了后唐。
左骁卫上将军杨复光于河中（山西永济）病故，杨复光虽是宦官，但为人慷慨忠义，待士卒很好，在军中有着崇高威望。他死后，军中为他痛哭数天。由其亲手组建的“忠武八都”，也在都将鹿晏弘等人统领下各自离去。
田令孜在朝中唯一惧怕的就是杨复光，听说杨复光病故，他喜出望外，立刻摒退了杨复光的义兄、时任枢密使的杨复恭，从此朝中再无人可与之抗衡。
十二月，被围困半年之久的赵犨实在熬不住了，派人潜出陈州，向邻近州府求援。
忠武军节度使周岌，感化军（今江苏徐州）节度使时溥，以及宣武军节度使朱温相继出兵支援。
朱温在鹿邑（河南周口市鹿邑县）击败老东家黄巢，斩首两千余级，乘胜夺占亳州。
中和四年（884年）正月，周岌、时溥、朱温抵挡不住义军攻势，联合向河东节度使李克用求助。
二月，李克用再次出马，率领五万汉胡混编军团自天井关进入河南——天井关亦称雄定关，太行八径之一，是古时从山西通往河南焦作的重要隘口。
河阳节度使诸葛爽担心李克用觊觎自己地盘，推托说河上的桥还没修好，并屯兵万善（河南焦作沁阳北）阻拒李克用。李克用无奈之下，只得又掉头从河中（山西永济）渡过黄河进入关中，然后再向东行。
绕了一个大圈，时至三月底，李克用方才抵达陈州（河南周口淮阳区），立即联合许、汴、徐、兖各路大军向义军发起进攻。
此时义军围困陈州已近一年，赵犨率陈州兵与之交战数百次，虽然粮食将尽，但民心士气益发高涨。
四月初三，唐军接连攻克太康、西华（均为河南周口下辖县），黄巢被迫撤军，向北退至故阳里（河南周口淮阳北），陈州包围解除，全城居民避免了沦为义军口粮的惨剧。
朱温见黄巢北进，担心汴州有失，急忙率军回返。
五月初三，暴雨倾盆而下，平地水深可达三尺！
黄巢军营被水所淹，加之听闻李克用将至，引军向汴州方向疾进，沿途屠灭了尉氏（河南开封尉氏县）。
尚让带着五千骑兵进逼大梁（开封别称），在繁台（今河南开封东南）被宣武大将朱珍、庞师古击退。
朱温忙向李克用告急！
五月初六，李克用自许州（河南许昌）出发；初八，在王满渡（河南中牟县以北渡口）追上黄巢，趁他们渡河之际发起突袭，义军全线崩溃，被斩杀万余人。
黄巢绕过汴州狼狈向北逃离，尚让率众归降了感化军节度使时溥；义军将领李谠、霍存、葛从周、张归霸则降于朱温。
尚让身为义军二号人物，在义军危难之时临阵叛敌，表现着实不咋地。关键他还没有眼光，投降了毫无节操的时溥。黄巢一死，时溥立即处死了尚让，还把他的一众妻妾全部卖到了妓院。
与之相反，李谠、霍存、葛从周、张归霸四人则因找对了人，后来都成了朱温的开国大将，在后梁位居高职。
五月初九，李克用在封丘（河南新乡封丘县）追上黄巢，义军早成了惊弓之鸟，哪里还有心思作战，被李克用轻易打散。
五月初十，大雨又至！黄巢继续向东逃走，李克用穷追不舍。
五月十一日，黄巢带着近千残兵逃奔兖州（山东济宁）。
李克用追到冤句（山东菏泽冤朐县），身边只剩下数百骑兵。他们一行昼夜奔驰了两百余里早就人困马乏，且身上携带的干粮也已吃完，只得暂时返归汴州，准备备齐粮食再行追击。
谁知这一去，不仅将马上到手的头功拱手送给了别人，还险些连性命也丢在汴州城里。