日莲给新兵卫和足利发信，就是为了秉承天皇的旨意，终结镰仓幕府的统治。
其实，日莲当初来到日本时，就对这种公武两家政权并行的形式感到惊讶和不可思议，这犹如当初东汉末年，曹操只统治着北方四州、兖州和司隶州，另外3个州和两京洛阳、长安都还在汉献帝的手中；
那几个州虽然曹氏实际控制着，但还要向长安称臣，甚至长安方面还不时派出官吏（虽然只是个形式），这种情况在天朝，很短的时间或许存在，但绝不可能国家长期是这种统治模式；
不过在这倭国，这却是存在100多年的状况，其实，在原时空中，也只有镰仓幕府搞成这个样子，后来的室町幕府和江户幕府，天皇就成为真正的吉祥物了，不过，在这个时空，再也不会出现什么室町幕府和江户幕府了。
新兵卫和石田跟元寇打了几场大仗，深知元寇凶悍，而且元寇如今的带兵之人，可谓是当世的战神一般的人物，他们对光靠幕府军击败元寇深感绝望，已经日益赞同日莲当初的想法了；
新兵卫如今还在平安跟元寇对峙，麾下6万众多是败退残兵和后来从镰仓补充过来的，包括原本监视京都的4万人马（最多时监视京都的人马达6万），这点人，元寇不来进攻就谢天谢地了（元军也无法进攻，只有7万人，还要2面防守）。
如今，镰仓大本营只剩下北条的8000卫军，虽然已经向东国诸藩要求出兵，但除了足利的2万多人马已到镰仓，其他诸藩只过来万把人，这点人马，如果京都想再来一次“承久之乱”，那估计会胜利了。
新兵卫本人和麾下家臣武士，都已对单独打败元寇不抱希望，如果天皇愿意给他们让点利益，这6万人很快就不再归北条所有。
至于足利，早就对北条不满，当初日莲法师要离开幕府去投天皇时，足利还有点可惜（虽然他赞同日莲的观点），现在，他只想联合京都，只要天皇点头并保证他和家臣们的一定利益，他今夜就可以反水。
日莲久在镰仓幕府，北条一直待他如上宾，甚至比信任家臣更为信任他，所以日莲对镰仓幕府内的各种人物关系可以说是了如指掌；
那足利最开始就跟北条有些意见不合，倒不是对北条家一直掌握幕府实权作了3代执权不满，而是对北条始终与京都处于敌对状态感到忧虑，10年前，元寇第一次入侵，足利担心战败，就有联合京都的打算；
但没想到，元寇会碰上“神风”，大败而回，于是，北条在大捷之余对他开始不信任起来，因为对镰仓来说，京都的那位，才是他们武家永远的威胁。
现在，足利人虽然还在镰仓，但心明显已经靠向京都，特别是这次元寇入侵，幕府连连战败后，他这种想法更强烈了。
之所以没有跟着日莲一起投向京都，一来目前镰仓还是武家利益的代表，他作为武家的支柱世家之一，如果投向京都，必将引起武家其余世家的极大愤概，定会群起而讨之；
而足利家族几代与京都作对，当年“承久之乱”足利家族也是为镰仓出了大力的，后来封赏也极为丰厚，而流放后鸟羽天皇和土御门天皇，足利家族都积极参与其中了；
如今他要是投向京都，后醍醐天皇能原谅这一切，并积极援助他这个必将因背叛而声名扫地的5藩“大守护”吗。
二来，还是实际利益上的问题，“承久之乱”和随后流放包括天皇在内的一众王侯贵族，让武家尤其是被称为“东国”的效忠幕府的各藩发了笔横财；
足利家族和属下的4藩得到了高达町的地头，后来又并吞了效忠天皇的所谓“西国”的一个藩，成为5藩“大守护”，也因此成为镰仓幕府的主要支柱之一。
如今为联合京都，足利愿意献出8000町，这也算是一个很大的诚意了，毕竟，那么多的家臣武士和部曲要养活，所以把以前所有夺自京都和“西国”诸藩的利益全部献出，根本是不可能的事；
只要天皇不那么苛刻，不要太过追究以前的利益，那么，足利是一定会投向京都的。
日莲深知这一点，为了打败元寇，必须联合武家，至于以前的事，除北条和少数顽固的家臣外，都可以既往不咎，包括他们夺自天皇和“西国”诸藩的利益；
其实，只要没收北条家和那几个顽固家臣的财产，基本上就把当年的损失补回一大半了，再撤掉或吞并十几个藩，利益的事情，就算完全达到目的了。
后醍醐天皇显然还没有这种远见，他既不清楚镰仓内部的实际情况，也不清楚元寇的实力，日莲只好深夜跑去跟天皇长谈，当他把所知道的所有情况跟天皇说清楚，并提出了自己的建议后，后醍醐天皇默认了他的意见，并在日莲给足利和新兵卫的书信上用了天皇大印。
很快，镰仓那边动荡的消息就传来了。
先是足利突然发难，宣布效忠天皇，并跟追随他的家臣武士和部曲公开了天皇的承诺，不仅不需要他和家臣们献出什么8000町地，反而还有额外的赏赐，足利部下2万多人高喊“天皇陛下万岁”，向镰仓发起了进攻，并要求北条等人放下武器。
北条也不是吃素的，马上召集忠于他的8000卫军，同时向已经到达镰仓的“东国”诸藩的1万多人马下达了“讨叛令”，这些人大部分已经接受了武家宣传的所谓“武士道”精神，对足利的背叛义愤填膺，满腔热血的向叛军杀去。
跟蒙元对峙的前线似乎还是静悄悄的，其实，京都在第一时间知道镰仓的叛乱后，并不是派兵去支援什么“忠皇军”，而是密切关注着前线的情况，并秘密出动了3万侍卫皇军，向平安前线集结。
其实，忻都此时虽然得到了1万精兵的援助，但还是无力发起大规模进攻，伯颜把兵力布防在四国通往本州的要地大阪湾一带，防止四国7藩增援本州。
这种情况下，忻都是没办法大规模进军的，只有在听到镰仓发生动荡时，他动了心思，但伯颜是何许人，他思考了一夜后，否决了动兵的意见；
在他看来，镰仓的动荡更多来自内部，而天皇集结在京都的十几万精锐，还根本一毛未损，这些兵力，随时都可以扑向元军。
果然，新兵卫刚刚带着1万多家臣和亲卫部队赶往镰仓，天皇的3万侍卫皇军就抵达了前线，不仅宣读了赦免所有武家将士的敕令，还对所有人承诺了远比幕府更丰厚的赏赐（镰仓幕府此时实际已经拿不出什么赏赐了）。
现在，伯颜和忻都面对的，是对面的8万多大军，还有随时准备渡海攻向大阪的7藩联军，他们除了坚守，在这场动荡中，并没什么太大的作为。
新兵卫的1万多人马的到来，给了北条很大的鼓舞，加上正奉命日夜兼程赶来的“东国”西部6藩3万多援军，北条几乎就要认定，足利授首之日不远。
然而，正所谓“人算不如天算”，新兵卫早就被京都说服买通了，他还联络了石田，他一到镰仓，石田就赶紧带着1000多人以平叛的名义来跟他汇合，随后，二人也出示了天皇的承诺，并迅速跟足利联合起来，攻打北条的驻地。
不过，北条的8000武士也不是吃素的，他们人人战至最后一刻，倒幕军每攻占一地，都要付出巨大的代价，但最让人担心的，是久攻不下，而效忠北条的3万多藩军正日夜兼程前来驰援。
不过，驰援大军在距离镰仓仅80余里的地方停住了，天皇的2万僧兵和2万侍卫皇军，拦在了前面，而忠于天皇的“西国”诸藩，也凑齐了5万联军，日夜赶往京都“勤王”。
见镰仓久攻不下，天皇在足利和新兵卫、石田等人付出了巨大代价后，最后终于派出2000僧兵和3000侍卫皇军赶来“增援”。
北条的首级被传到对峙在镰仓西北部的武家军队，同时传到的，还有天皇赦免的敕令，“东国”诸藩大部动摇了，坚决要“战斗”的3个藩的武士冲向天皇军队，在其余各藩的观战下，全部覆灭了。
北条及其家臣，还有死忠幕府的各藩的土地、财产、人口，都成了天皇对有功将士的赏赐。
只有付出巨大代价的足利、新兵卫和石田，不仅没得到什么赏赐，还被迫吐了些利益出来，毕竟，天皇的赦免令不是那么好拿到的，更何况，他们现在已经没什么力量来提意见了，大部分利益保住了，就已经是最好的结果了。
眼见皇国一统，最高兴的反而是日莲这个中原人，宋国宗室，“终于可以集中全日本的力量，跟元寇决一死战了”日莲很是兴奋。
很快，京都的天照大神后裔发出了敕令——派出使臣，跟蒙元议和。