宇宙新生的曙光尚未完全驱散归零后的阴霾，星盟总部的量子监测网突然泛起诡异的波纹。阿依娜的全息投影剧烈闪烁，画面中跳出一串无法解析的超维代码：“检测到全宇宙时空结构出现‘因果悖论震荡’！所有文明的历史与未来正在发生错位重叠！”林羽手中的镇魔剑突然迸发暗紫色光芒，剑身纹路扭曲成莫比乌斯环状，隐隐传来古老而沧桑的叹息。沈梦璃的意识体在本源之力中剧烈扭曲，化作无数交织的光带：“这是‘轮回序章’的启动信号，维度管理局的最终后手……他们要让文明在无尽的轮回中耗尽所有可能性！”
深空之中，数以万计的时空漩涡凭空出现。某些星系的恒星开始逆向燃烧，行星表面同时显现出原始海洋与未来都市的景象；而另一些星域，历史中的文明遗迹与尚未诞生的科技产物重叠存在。更诡异的是，部分文明的居民发现自己拥有了“前世记忆”——有人记起曾作为归零前的战士战死沙场，有人目睹过未来自己亲手摧毁家园的场景。这种认知混乱迅速引发全宇宙的社会动荡，不同时空的“自我”甚至在现实中相遇，引发激烈冲突。
林羽紧急组建“时空锚点特遣队”，却发现常规的时空穿梭技术完全失效。当星舰试图穿越漩涡，竟直接被抛送至某个文明尚未诞生的远古时期。“这些时空漩涡是‘轮回裂隙’，”阿依娜的声音带着焦虑，“它们正在将宇宙切割成无数个独立的轮回碎片，每个碎片都遵循不同的因果律。我们必须找到能统合所有时空的‘本源时计’，但它的存在早已在归零中成为传说……”
在探索被裂隙侵蚀的星域时，特遣队遭遇由时空悖论具象化的“因果怪物”。“宿命之蛇”能提前预知攻击并反向施袭，“逆时之影”则会将敌人的行动拖入无限循环的时间牢笼。战斗中，一名队员的攻击尚未发出，就已承受来自未来的反击；另一名队员则被困在重复的十秒时空，无论如何挣扎都无法逃脱。林羽挥舞镇魔剑，将七种本源之力与文明对时间的集体认知融合，创造出能斩断因果循环的“破局之刃”，剑刃划破虚空的瞬间，扭曲的时空终于出现一丝缝隙。
与此同时，星盟的考古学家们在阿依娜的带领下，从远古文明的残垣断壁中发现惊人线索。“本源时计并非实体，而是一种‘时间意志’，”阿依娜将破译的古老碑文投影出来，“它沉睡在宇宙诞生之初的‘混沌节点’，但唤醒它需要七个文明在不同时空的‘命运共鸣’——在轮回的每个碎片中，都存在着关键的‘时间锚点’。”
林羽在寻找时间锚点的过程中，意识多次被卷入不同的时空碎片。他见证了机械文明在轮回中反复经历科技爆炸与自我毁灭，目睹魔法文明在宿命循环中与远古恶魔签订永无止境的契约。在某个荒芜的星球上，他遇见了一位自称“轮回守望者”的神秘存在，对方递来一枚刻满星图的怀表：“时间的真谛，不在于改变过去，而在于守护每个当下。”
当集齐七个时空碎片的命运共鸣后，林羽带领众人来到混沌节点所在的超维空间。这里悬浮着一个由无数沙漏组成的巨型装置，每个沙漏都流淌着不同颜色的沙粒，代表着无数平行时空的命运。维度管理局残存的意识从装置中浮现，它的形态是一团由破碎的时钟齿轮组成的能量体：“低维生物，在无尽的轮回中，你们终将明白反抗毫无意义。”
林羽将七个时空的命运共鸣与镇魔剑融合，剑身爆发出能照亮所有时空的银白光芒。他与沈梦璃的意识完全融合，将全宇宙文明对自由意志的坚守、对打破轮回的渴望注入剑身：“我们的命运，不该由他人书写！”镇魔剑挥出“永恒刹那”，蕴含着文明自由意志的光芒，直击本源时计的核心。
在剧烈的能量碰撞中，林羽终于唤醒了时间意志。残存意识的身体开始崩解，那些代表轮回枷锁的齿轮被自由之光彻底粉碎。“不可能……轮回……本应是永恒……”意识的声音充满不甘。随着一声跨越时空的钟鸣，所有的轮回裂隙开始闭合，错位的时空逐渐回归正轨。
战斗结束后，宇宙虽然恢复平静，但留下了不可磨灭的印记。许多文明开始记录不同时空的“平行历史”，星盟建立了“时空档案馆”，用以铭记这场与命运的博弈。林羽将命运共鸣的力量分散融入宇宙各处，作为守护时空稳定的防线。阿依娜的检测显示，在宇宙最深处，仍有微弱的轮回波动若隐若现。沈梦璃的意识体萦绕在他身旁，轻声道：“只要文明存在，与命运的抗争就永不停息。但这一次，我们证明了自由意志的力量足以撼动轮回。”
而在超维空间的裂缝中，一枚破碎的沙漏突然开始逆向流转，沙漏表面浮现出一行闪烁的文字：“轮回序章失败，启动‘终焉回响’——当所有可能性耗尽，文明终将在寂静中迎来真正的终局。”新的危机，正在超越认知的维度深渊中悄然酝酿，等待着给这个重生的宇宙带来终极挑战。