日光浴场的凶杀案，在工藤优作（肖恩博士）的卓越推理和柯南（汤米）在暗处敏锐的观察与线索提示下，真相很快水落石出。
死者是一位试图勒索多名富豪的商业间谍，他掌握的秘密足以毁掉几个显赫家族。凶手正是其中一位被勒索者的私人保镖，为了保护雇主的名誉和利益，在死者企图在邮轮上再次敲诈时，选择了最极端的灭口方式。那枚刻着“A.m.”的袖扣，是凶手在搏斗中不慎被死者扯下，其主人阿米尔·马苏德只是不幸被牵扯的无辜者。
证据确凿，凶手被船上的安保控制，移交给了随后乘直升机赶来的海上警察。一场风波看似平息，船上的秩序逐渐恢复。
然而，柯南、悠真和优作心中却没有丝毫轻松。案件解决的过程消耗了宝贵的时间！他们立刻将注意力重新投向之前锁定的b区那个可疑房间。
趁着船上因命案导致的短暂混乱和安保力量被调动的空隙，三人加上悄然汇合的快斗（迭戈），迅速突入了那个被严密看守过的房间。
房间内空空如也！只有几台被物理破坏、无法恢复数据的电脑主机，以及一些无关紧要的杂物散落在地。空气中弥漫着一股淡淡的、刻意喷洒的消毒水气味，显然是为了掩盖可能残留的痕迹。
“来晚了！”柯南一拳砸在墙壁上，小脸上满是懊恼和不甘，“被耍了！琴酒根本不在这里！那个所谓的‘交易’地点，根本就是个幌子！”
优作眉头紧锁，环顾四周：“组织撤退得非常干净利落，早有准备。他们利用命案制造的混乱，完美地金蝉脱壳了。”
“调虎离山…”悠真（里奥）的声音异常冰冷，眼神锐利如刀。他猛地抬头，仿佛穿透了层层甲板，望向遥远的东京方向，“琴酒的目标…从来就不是这艘船！”
他迅速拿出一个经过多重加密的微型通讯器（非船上网络），接通了一个特殊频道：“平次！FbI！东京情况如何？是否有异常？！”
通讯器那头立刻传来服部平次急促的声音：“悠真大哥！东京这边不对劲！我们和FbI的赤井先生按照你的备用方案，一直盯着毛利大叔的事务所附近！就在十分钟前，我们发现几辆可疑的无牌车辆停在了事务所对面的废弃大楼下！有人上去了！动作很专业，带着长条箱子，像是…狙击器材！”
紧接着，赤井秀一那标志性的低沉嗓音响起，带着前所未有的凝重：“确认。目标锁定为毛利侦探事务所。狙击手已就位，尚未开火，似乎在等待指令。我们正在尝试隐蔽接近，但对方占据制高点，视野开阔，强攻风险极大。悠人君，你的判断是对的，琴酒的目标是源头——他误以为放置追踪器的是毛利小五郎！”
东京，米花町。
夜色笼罩下的毛利侦探事务所，窗户透出温暖的灯光。楼下波洛咖啡厅已经打烊，街道显得格外安静。
然而，在这份平静之下，杀机已然降临。
事务所对面，那栋废弃的写字楼顶层天台边缘。
琴酒银色的长发在夜风中微微飘动，如同死神的旌旗。他嘴里叼着烟，猩红的眼眸透过高倍夜视望远镜，清晰地锁定着对面三楼窗户后那个正一边喝啤酒、一边对着电视里的冲野洋子节目哈哈大笑的邋遢身影——毛利小五郎。
伏特加站在他身后，抱着一个沉重的装备箱，脸上带着残忍的兴奋。基安蒂则在不远处，用狙击枪的瞄准镜同样锁定了目标，嘴里嚼着口香糖，发出不耐烦的啧啧声。
“哼，名侦探毛利小五郎…”琴酒的声音冰冷得不带一丝温度，充满了被愚弄的怒火，“藏得够深啊。表面上是个糊涂侦探，暗地里却屡次三番跟我们作对！利用那个小鬼当幌子？真是好算计！”他完全将追踪器的放置归咎于这个“声名鹊起”的侦探，认为柯南只是对方推出来的烟雾弹。
“大哥，直接干掉他吗？”伏特加瓮声瓮气地问。
“不。”琴酒放下望远镜，眼中闪烁着猫捉老鼠般的残酷光芒，“就这么让他死了，太便宜他了。我要让他…在极致的恐惧中下地狱！科恩！”
一直如同岩石般沉默寡言、趴在最佳狙击位上的科恩，闻声微微调整了一下姿势，冰冷的枪口稳稳地对准了毛利小五郎的头颅。他的手指，轻轻搭在了扳机上。
“打断他一条腿。”琴酒冷酷地下令，“让他像条蛆虫一样在地上爬！在他最痛苦、最无助的时候…再送他上路！”
“了解。”科恩毫无感情地应道，狙击镜的十字准心牢牢套住了毛利小五郎的右腿膝盖。