金陵城的春汛来得格外汹涌，秦淮河水位暴涨，浑浊的浪头拍打着堤岸，卷走了岸边漂浮的枯枝败叶。王承宗跪在玄机子的衣冠冢前，手中握着那半块刻着“天机”的玉佩，雨水顺着他的蓑衣往下淌，模糊了墓碑上“玄清真人之墓”几个字。怀中的杨洪一突然拽住他的衣袖，咿咿呀呀地指着远处水面。
一具浮尸顺着水流漂来，身上穿着的道袍让王承宗瞳孔骤缩——那是玄机子最常穿的月白色道袍。他顾不上暴雨，纵身跃入河中，将尸体拖上岸。死者面容已经浮肿，但右手死死攥着的物件却让王承宗如遭雷击——正是玄机子从不离身的青铜罗盘，背面刻着的“崇祯十五年制”字样在雨水中泛着冷光。
“这不可能...”王承宗颤抖着打开罗盘，夹层里掉出一卷密诏。泛黄的宣纸上，朱砂御印虽已褪色，但“大明崇祯皇帝诏曰”几个字依然清晰可辨。诏书中赫然写着：“着锦衣卫百户玄真，化名玄机子，潜伏江湖，暗查南明余孽与藏宝图下落，必要时可牺牲一切...”
惊雷炸响，照亮了王承宗苍白的脸。他突然想起玄机子教他识药时说过的话：“最毒的药往往藏在最不起眼的地方。”当时以为是在讲药理，此刻却惊觉，这句话或许是师父早就留下的暗示。而更令他毛骨悚然的是，诏书中提到的“必要时可牺牲一切”，是否包括当年那场精心设计的“先帝遗孤”骗局？
当夜，王承宗带着杨洪一来到城郊破庙。烛光摇曳中，他将密诏铺在神案上，反复研读。突然，庙外传来一阵急促的脚步声，七八个黑衣人将破庙团团围住。为首之人摘下面罩，竟是本该死去的徐承业！可细看之下，此人眼神清澈，举手投足间没有半点癫狂之态。
“王兄，别来无恙。”徐承业微笑着拱手，从怀中掏出另一卷密诏，“这是家父临终前交给我的，原来二十年前那场大火，本就是崇祯皇帝为了斩断南明复辟希望设下的局。玄机子，不，应该叫玄真大人，正是这个局中最关键的棋子。”
王承宗握紧剑柄：“你以为编出这种谎言就能骗过我？”话音未落，破庙四壁突然亮起幽蓝磷火，墙壁上浮现出密密麻麻的文字，正是当年崇祯皇帝与玄机子的密信往来。信件中详细记载了计划的每一个细节：用秘术制造“皇室血脉”的假象，引诱各方势力自相残杀，而真正的藏宝图，其实是记载着明朝龙脉所在的舆图。
杨洪一突然开始啼哭，小脸涨得通红。王承宗低头看去，孩子颈后的太极印记竟开始发烫，化作一道流光没入他的掌心。与此同时，徐承业带来的密诏也产生共鸣，自动展开新的内容：“若玄真不幸暴露，可将真相告知王家后人，其血脉中的奇血能压制龙脉异动...”
就在这时，破庙屋顶轰然坍塌，数十名锦衣卫从天而降。为首的千户冷笑一声，举起绣春刀：“徐小公子，你以为拿到密诏就能翻案？当年你父亲私通南明，本就是罪该万死！至于这个假皇子...”他的刀尖指向杨洪一，“留着终究是个祸患！”
王承宗护着孩子后退几步，心中翻涌着滔天巨浪。玄机子教他的每一招每一式，说过的每一句话，此刻都在脑海中回放。原来那个总是摸着他头说“承宗长大了”的师父，竟是背负着皇家使命的密探；那个看似天真无邪的杨洪一，从一开始就是个精心设计的诱饵。
“且慢！”徐承业突然站到王承宗身前，“各位可知道，如今的朝廷早已不是当年的大明？紫禁城龙椅上坐着的，不过是个冒牌货！真正的龙脉，已经被奸人篡改，若不及时纠正，不出三年，天下必将大乱！”
千户闻言脸色骤变，绣春刀微微颤抖：“你...你胡说！”但他眼底闪过的一丝慌乱，却没能逃过王承宗的眼睛。王承宗握紧玉佩，奇血在体内沸腾，他突然想起玄机子临终前含糊不清的“天工坊”——那或许不是指某个地点，而是“天机”与“工坊”的双关语，暗示着真相藏在皇家工坊的秘档里。
就在双方剑拔弩张之际，杨洪一突然伸手抓住王承宗的剑穗。奇异的事情发生了，孩子眼中闪过一道金光，地面开始剧烈震动。王承宗怀中的三块玉佩同时飞起，在空中拼成完整的舆图，而舆图上的标记，竟直指紫禁城地下！
“龙脉异动，就在此刻！”徐承业大喊，“当年玄真大人发现龙脉被改，才会冒险制造皇室血脉的假象，试图引出幕后黑手！”千户再也按捺不住，下令锦衣卫动手。混战中，王承宗抱着杨洪一冲出重围，他知道，想要揭开师父的真实身份，找到真正的龙脉真相，就必须潜入那座充满秘密的皇宫。
暴雨依旧在下，王承宗望着怀中的孩子，又看了看手中的舆图。曾经坚信的一切轰然倒塌，新的谜团却更加扑朔迷离。玄机子究竟是忠于大明的忠臣，还是另有图谋？杨洪一的命运又将走向何方？而那隐藏在紫禁城深处的龙脉，又牵扯着怎样惊天的阴谋？前路迷雾重重，但王承宗知道，他已经没有退路。