方舟计划的发现让林枫团队陷入了更深的忧虑。他们暂时阻止了所罗门的控制计划，但真正的威胁似乎才刚刚浮出水面。在接下来的几周里，林枫调动所有资源追踪方舟计划的线索，却始终一无所获。
就在调查陷入僵局时，一个意外的突破口出现了。某天清晨，林枫收到一个匿名包裹，里面是一本破旧的航海日志。日志的主人是一位名叫陈建国的老船长，记录着二十年前一次特殊的远洋科考任务。
我们在北纬32度14分发现了一个人工岛屿，日志中的一页写道，岛上设施先进得超乎想象，但空无一人。
林枫立即让团队核实这个坐标。卫星图像显示，那里确实有一个小岛，但所有公开地图都没有标注。更奇怪的是，该区域被多个国家列为航空禁飞区。
这里可能就是方舟计划的实施地。陆明轩判断。
为了查明真相，林枫组织了一支探险队前往该海域。在经历艰难航行后，他们果然发现了一个被伪装成自然岛屿的人工基地。基地内部空无一人，但所有设备都在自动运行。
在控制中心，他们找到了方舟计划的完整文件。计划的真相令所有人震惊：这不是另一个控制计划，而是一个文明重启方案——当人类社会崩溃时，这里将释放出保存的人类胚胎和文明资料，开启新的轮回。
所罗门不是想控制文明，而是准备在必要时重启文明。苏晚晴难以置信地说。
更令人不安的是，文件显示这样的基地在全球还有六个，分别由不同的秘密组织控制。而启动条件竟然是当全球自由意志指数低于阈值。
返航途中，林枫团队遭遇了神秘潜艇的跟踪。在即将被拦截时，一支联合国特别行动队突然出现，护送他们安全返回。
我们是守护者联盟行动队指挥官自我介绍，一个致力于防止文明崩溃的国际组织。
指挥官告诉林枫，守护者联盟已经存在了半个世纪，成员包括各国前政要、科学家和商界领袖。他们一直在暗中监视这些方舟基地，确保不会被滥用。
所罗门曾经是我们的一员，指挥官透露，但他逐渐偏执，认为人类需要被。
回到总部后，林枫决定将方舟计划的存在公之于众。但这个决定遭到了守护者联盟的强烈反对。
公众知情可能引发恐慌，联盟代表在视频会议中警告，而且会暴露我们的监控网络。
就在双方争执不下时，新的危机爆发了。全球多个重要港口突然瘫痪，货运系统陷入混乱。调查发现，这是由一个自称自由方舟的黑客组织所为。
我们在解放人类，该组织在声明中宣称，打破旧系统，新文明才能诞生。
林枫立即意识到，这是所罗门的追随者在行动。他们可能获得了某个方舟基地的控制权。
通过追踪黑客攻击的源头，团队定位到了位于南极的第二个方舟基地。这一次，守护者联盟同意联合行动。
南极行动比预想的更加艰难。基地防御系统极其先进，联合部队损失惨重。当终于突破核心区域时，他们见到了意想不到的领导人——莎拉博士。
所罗门老师看错了你们，莎拉冷笑着说，他以为你们会理解这个计划的必要性。
在她准备启动文明重启程序的那一刻，马修突然出现并制服了她。这次我选对了边，他对林枫说，有些人性的东西，值得守护。
事后调查显示，莎拉控制了南极基地，计划通过制造全球危机来触发重启程序。而马修这次是真心倒戈，因为他发现莎拉的计划将导致数十亿人死亡。
林枫没有将方舟计划公之于众，而是与守护者联盟达成了合作协议。他们将在不引起恐慌的前提下，共同监控这些基地。
在最后一次关于方舟计划的会议上，一位年迈的联盟成员对林枫说：知道吗？最困难的不是对抗敌人，而是在知道真相后仍然保持希望。
林枫望向窗外熙熙攘攘的街道，轻声回应：也许正因为知道黑暗的存在，我们才更要珍惜每一盏灯火。
夜幕降临，城市的霓虹依次亮起。在某个不为人知的角落，新的挑战或许正在酝酿。但此刻，林枫选择相信：只要还有人愿意在黑暗中点燃火炬，黎明终将到来。