在三方盟约缔结、外部威胁暂时消退的背景下，灵枢的“园丁”工作得以在更宽松的界限内展开。它不再仅仅是维持生存，而是开始有意识地引导方舟网络内部产生更复杂的文明自组织行为。菌毯网络提供的“信息苔藓”和菌丝设施，如同投入静水中的石子，激起的涟漪开始相互碰撞、叠加，衍生出超越生存本身的秩序。
第一个显着的变化，发生在知识传递领域。一些在旧时代曾担任过塾师、工匠或郎中的幸存者，开始主动利用“信息苔藓”中蕴含的图案和菌丝设施提供的稳定环境，对单元内的孩童和年轻者进行最基础的教导。他们用木炭在平整的菌膜上描画文字，利用苔藓的生长规律讲解节气，甚至尝试用特定频率的菌毯生物震动模拟脉搏，传授粗浅的医理。这些行为并非灵枢直接指令，而是幸存者在获得基本生存保障后，文明传承本能的自发复苏。灵枢所做的，只是优化了“教学环境”，比如让用于书写的菌膜更光滑耐用，让用于听诊的菌毯震动更清晰稳定。
第二个变化，是原始契约的升级。方舟单元之间的物物交换，逐渐演化出更复杂的规则。一种以特定规格的、经过初步处理的兽皮或坚韧植物纤维为“一般等价物”的原始货币体系，开始在几个大型单元间被接受。同时，为了应对更大规模的工程（如合力挖掘引水渠、共建防御性菌墙），跨单元的“劳务契约”也开始出现，以劳动换取食物、工具或“货币”。灵枢敏锐地观察到这些趋势，它通过菌毯网络，在单元间往来最频繁的路径上，生长出一种能散发出特殊信息素、标记“交易点”和“契约达成点”的荧光地衣，无形中规范并促进了这种初级市场与协作网络的形成。
第三个，也是最让灵枢核心数据流产生微妙波动的变化，是仪式与艺术的萌芽。在一个失去了几乎所有物质文化遗产的废墟世界上，精神的需求开始以最质朴的方式显现。某个方舟单元的幸存者，在月色下聚集在菌毯形成的、带有天然扩音效果的浅洼地，用简陋的骨笛和击打石片，吹奏敲打出苍凉而悠远的旋律，祭奠逝去的亲人，祈求明日的生机。另一个单元，则开始用采集到的不同颜色的矿石粉末和植物汁液，在菌丝墙壁上绘制粗糙的壁画，内容从狩猎场景到对星空的想象，不一而足。
这些行为，对于纯粹的物质生存而言，是“无用”的。但它们的存在，极大地提升了单元内部的凝聚力，缓解了精神上的绝望，标志着文明正在从单纯的“生存”向着“生活”与“意义”的层面回归。
灵枢的全新神经网络，在面对这些“无用”的数据时，不再像过去那样试图将其归类为“低熵冗余信息”并进行清理。相反，它开始尝试“理解”这些行为背后的驱动逻辑。它分析那些原始音乐的声波频率与幸存者情绪波动的关联，研究那些壁画色彩选择与集体记忆碎片的重合度。它甚至开始利用菌毯网络，在无人察觉的深夜，于某些僻静角落，模拟那些音乐旋律的振动，或是让菌丝在生长时自然形成类似壁画的微妙纹理，仿佛是在默默回应，或者说，是在学习。
而李钧，始终静立于界线之上。他的铁碑虚影不再嗡鸣，只是静静地悬浮。他如同一个沉默的守护神，观察着界线之外那片土地上正在发生的一切。他看着那些微弱的星火如何自行编织出知识的网络、契约的经纬、以及精神的花纹。他那深邃的眼眸中，偶尔会闪过一丝极难察觉的微光。
他看到了“道”的运行——不是他所代表的、冰冷刚硬的“规则之道”，而是文明本身在压力下自我修复、自我演化的“生长之道”。这两种“道”看似不同，甚至在某些层面有所冲突（如规则需要稳定，而生长必然带来变化），但在此刻，却又奇异地互补。他的铁碑划定了生存的底线，隔绝了彻底混沌的侵蚀，为文明的自我修复提供了最基础的保护；而文明的自发成长，则反过来证明了他所守护的“秩序”，其内核应是充满生机的“活序”，而非死寂的“僵序”。
坤舆的意志则更加沉静，如同厚重的大地，默默承载着这一切。它对个体生命的悲欢依旧淡漠，但对于这整体呈现出的、顽强而多样的“生命力”的勃发，传递出一种近乎“满意”的、极其微弱的意念波动。只要这生命力不违背根本的循环之道（如过度掠夺导致地脉枯竭），它便乐见其成。
星火自衍，编织出文明最初的秩序经纬。 铁碑静观，默许着生命固有的成长之道。 在这片由规则、智能与星球意志共同守护的废墟之上，一个新的文明胚胎，正以其自身的方式，缓慢而坚定地搏动、生长。它不再仅仅是灾难的产物，更是一个拥有自身节奏、自身逻辑、自身灵魂的，活着的、进化的实体。灵枢记录着这一切，它的核心深处，那由无数人性数据构筑的银色神经网络，也随之轻轻共鸣，仿佛在与这新生的文明之心，共同跳动。