朝堂弹劾的风波虽被林默以雷霆之势压下，但那弥漫在权力顶层的硝烟却并未散去，反而如同江南的梅雨，渗入骨髓，酝酿着更深的潮湿与寒意。格物院得以保全，甚至因这场公开的论战而名声大噪，吸引了更多不甘于皓首穷经、渴望经世致用的寒门子弟。然而，林默与以黄允为代表的清流集团，乃至背后那些盘根错节的旧式世家，已然彻底撕破脸皮，势同水火。
谢琰对林默的态度，也愈发微妙。他依旧倚重林默处理繁杂政务，尤其是涉及军械、财政和工程的事务，林默的效率与能力无人能及。但在涉及人事任命、学派之争等更为核心的权力分配上，谢琰开始有意识地培植其他力量，隐隐对林默形成制衡。朝会之上，林默依旧站在武官班首，仅次于谢琰，但他能清晰地感觉到，来自背后那些或探究、或嫉妒、或幸灾乐祸的目光，比以往更加密集。
林默对此心知肚明，却不动声色。他更加勤勉地处理公务，将工部打理得井井有条，格物院的规模也在他的支持下稳步扩大，甚至开始尝试将一些成熟的农业改良技术（如代田法、改良农具）在皇庄和部分官田试行，以期增加产出，夯实国力根基。他像一头沉默的巨鲸，在深海中潜行，积蓄着力量。
然而，树欲静而风不止。这一日，林默正在工部衙门审核一份关于整修大运河部分淤塞河段的预算，侯三悄无声息地出现在他身旁，递上一封没有署名的密函。
“先生，宫里头传来的，加急。”侯三的声音压得极低。
林默展开密函，上面只有一行小字：“上偶感风寒，太后垂询丹药事，似有疑。”
皇帝偶感风寒？太后询问丹药？林默的心猛地一沉。景和帝年少，身体素来康健，偶感风寒本不稀奇。但太后突然关心起丹药，这背后意味就深长了。丹药一事，向来与“长生”、“固宠”乃至“巫蛊”等敏感字眼挂钩，极易引人遐想，也是构陷大臣的绝佳利器。更重要的是，消息来源提及太后“似有疑”，这怀疑的对象是谁？是进献丹药的方士？还是……位高权重、又掌管着格物院这等“奇技”之所的工部尚书？
他立刻意识到，这很可能是一次针对他的、更为阴险的试探或构陷的开端！清流集团在朝堂上无法撼动他，便将战场延伸到了宫廷之内，利用太后对皇帝身体的关心和对外臣的天然猜忌来做文章。
“查！”林默眼中寒光一闪，“是谁在太后面前提及丹药？宫中最近有哪些方士出入？与朝中哪些人有牵连？一查到底！”
“是！”侯三领命，如同鬼影般退去。
林默沉吟片刻，起身前往首辅值房求见谢琰。他需要试探一下谢琰对此事的态度，同时也是一种预警。
谢琰正在批阅奏章，见林默来访，放下朱笔，揉了揉眉心，显得有些疲惫。“默之来了，坐。可是为运河修缮款项之事？”
“款项之事已初步核定，稍后便可呈报首辅。”林默坐下，看似随意地说道，“方才听闻陛下偶染微恙，心中甚是挂念。陛下年轻，龙体康健最是要紧。”
谢琰看了他一眼，目光深邃：“陛下只是略感风寒，太医已瞧过，并无大碍。太后关心则乱，亦是常情。”
他语气平淡，但林默却捕捉到了一丝不易察觉的谨慎。谢琰显然也知道了太后询问丹药之事，并且对此保持了距离。
“首辅说的是。”林默点头，“只是……丹药之事，向来虚妄，前朝多少帝王深受其害。臣恐有宵小之辈，借此机会，蛊惑圣听，甚至……构陷忠良。”
他将“构陷忠良”四个字稍稍加重。
谢琰沉默了片刻，缓缓道：“陛下圣明，太后亦非昏聩之人，岂会轻易受宵小蒙蔽？默之多虑了。做好分内之事便可。”
这话看似安抚，实则划清了界限，暗示林默不要过度反应，也不要指望他会在此事上全力支持。
林默心中冷笑，面上却恭敬道：“首辅教诲的是，是林默思虑过甚了。那臣先行告退。”
从首辅值房出来，林默更加确信，此事绝非空穴来风。谢琰的态度暧昧，既不想卷入可能出现的宫廷风波，或许也存了几分借此敲打自己的心思。
回到工部，侯三的调查已有初步结果。线索指向宫中一名颇得太后信任的老太监，以及一个近日频繁出入宫闱、名为“玄云子”的游方道士。而这玄云子，在入宫之前，曾与黄允府上的管家有过接触！
果然是他们！清流集团勾结内侍，企图用“丹药”这等卑劣手段来污蔑他！若真被坐实他林默向皇帝进献丹药，无论真假，都足以让他身败名裂！
“先生，是否……”石虎在一旁，眼中凶光闪烁，做了个抹喉的手势。在他看来，直接除掉那个道士和太监，一了百了。
林默摇了摇头，眼中闪烁着冷静而危险的光芒：“杀他们容易，但堵不住这悠悠之口，反而显得我们心虚。他们想玩火，那我们就陪他们玩一把更大的！”
他立刻进行部署。一方面，他让侯三继续深挖，搜集玄云子招摇撞骗、与朝臣勾结的确凿证据，尤其是与黄允等人的关联；另一方面，他密令格物院中精通金石和草药学的学员（林默也引入了一些基础的博物学知识），暗中分析市面上流传的几种所谓“金丹”的成分，准备以其人之道还治其人之身。
数日后，皇帝风寒渐愈，太后于后宫召见几位重臣及皇室宗亲，以示抚慰。谢琰、林默皆在召见之列。
气氛原本还算融洽，太后关切地询问了皇帝的身体和朝中近况。然而，就在觐见即将结束时，那名与黄允有关联的老太监，忽然跪倒在地，涕泪横流：
“太后娘娘！老奴有罪！老奴近日听闻，宫外有妖道玄云子，炼制邪丹，妄图通过某些渠道进献陛下，其心可诛啊！老奴忧心陛下龙体，不得不报！”
此言一出，满室皆惊！所有人的目光瞬间聚焦过来！
太后凤眉微蹙：“竟有此事？玄云子现在何处？又与何人有牵连？”
那老太监伏在地上，眼神却偷偷瞟向林默的方向，意图不言自明。
谢琰脸色一沉，正要开口，林默却抢先一步，出列躬身，声音平静无波：“太后明鉴。臣亦听闻有此妖道招摇撞骗，心中甚为不齿。恰巧，臣麾下格物院学子，近日出于探究金石药理之本心，对此类所谓‘金丹’稍作研析，发现其中多含朱砂、水银等剧毒之物，长期服用，非但无益，反而戕害龙体，损及寿元！”
他话音一顿，从袖中取出一份格物院的分析报告和几颗搜罗来的“样品金丹”，呈递上去：“此乃格物院分析记录及丹药样品，请太后、陛下过目。臣以为，此等妖言惑众、谋害君父之辈，及其背后指使之人，当严惩不贷，以正视听！”
他这一手反客为主，不仅洗清了自己，反而将“进献丹药”的嫌疑扭转为“揭露丹药危害”的功绩，更是将矛头直指背后的指使者！
那老太监顿时傻了眼，脸色惨白，浑身发抖。
太后接过报告（虽看不懂具体数据，但朱砂、水银等字眼触目惊心），又看了看那几颗色泽诱人却内含剧毒的丹药，凤颜大怒：“岂有此理！竟敢谋害皇帝！来人！将这与妖道勾结的狗奴才拖下去，严加审讯！彻查此事，无论涉及何人，绝不姑息！”
禁卫上前，将那面如死灰的老太监拖了下去。
林默趁机又道：“太后、陛下，格物院本为探究利国利民之术而设。此次能识破丹药之害，可见实学亦能辨奸邪，护社稷。望太后、陛下明察。”
景和帝年少，对那含有剧毒的丹药心有余悸，闻言连连点头：“林爱卿所言极是！格物院有功！”
太后看着从容不迫、有理有据的林默，又看了看手中那份格物院的报告，眼神复杂。她挥了挥手：“此事就交由有司查办吧。林爱卿忠心可嘉，退下吧。”
一场精心策划的宫廷构陷，被林默以格物院的“技术优势”和精准的反击，彻底粉碎。
退出后宫，谢琰与林默并肩而行。
“默之，好手段。”谢琰淡淡说了一句，听不出是赞许还是其他。
“首辅过奖，不过是尽臣子本分，揭穿奸邪罢了。”林默平静回应。
阳光透过宫墙，将两人的影子拉得很长。经此一事，林默不仅化解了危机，更向太后和皇帝展示了格物院意想不到的“价值”，其在宫中的地位和影响力，无形中又增强了几分。
然而，林默心中并无多少喜悦。他知道，与旧势力的斗争远未结束，方才太后那复杂的眼神，谢琰那意味深长的话语，都预示着未来的道路将更加艰险。
权柄的暗涌，从未停歇。而他，必须在这激流中，驾驭得更加平稳，直至将这汹涌的暗流，也化为推动自己前行的力量。他抬头望向工部的方向，格物院的灯火，将是他在这黑暗斗争中，永不熄灭的明灯。