经此一役，大明上下欢呼雀跃，百姓们纷纷传颂着江湖豪杰与将士们的英勇事迹，林羽之名更是家喻户晓。朝廷论功行赏，林羽本欲推脱，却拗不过镇远侯的坚持，被封了个游击将军之职，专司训练新兵，以防北漠余孽再犯。
林羽虽身在军中，却心系江湖。他时常想起并肩作战的各派高手，牵挂着他们战后的境遇。一日，林羽正在校场练兵，忽有传讯兵来报，说有访客求见。林羽迎出去，只见一位身着道袍的青年男子，面容清俊，背负长剑，竟是武当派的首席弟子苏御。苏御拱手笑道：“林将军，别来无恙，我奉掌门之命，特来探望。”林羽喜出望外，拉着苏御进帐叙旧。交谈间，林羽得知各大门派在战后都忙着休养生息，同时也在整顿门规，期望能为江湖培育更多正气之士。苏御还带来一个消息，江湖中出现了一些诡异传闻，有不少散修武者莫名失踪，生死不明。
林羽心中一惊，直觉此事或许与北漠有关，虽天狼王已死，但难保北漠不会有新的阴谋。他决定向镇远侯请辞一段时日，深入江湖调查此事。镇远侯深知林羽的脾性，思索再三后应允，并叮嘱他务必小心。林羽收拾行囊，与苏御一道踏上江湖之路。
二人沿着商路前行，一路打听消息。在一个名叫飞云镇的地方，听闻此地昨夜发生了一场离奇命案。死者是一位独行镖师，死状凄惨，浑身经脉尽断，财物却未丢失分毫。林羽与苏御赶至事发客栈，仔细勘查现场。林羽发现死者身旁有一些奇特的脚印。
林羽蹲下身子，仔细端详，发现这些脚印步伐间距极大，且足跟处深陷，显然发力之人轻功卓绝却又身形沉重，不似中原武人寻常路数。再看那脚印边缘，竟有一圈若有若无的细碎沙砾，他心中一动，与苏御对视一眼，二人皆从对方眼中看到了疑虑——这脚印透着股子来自塞外的粗犷气息，莫不是北漠之人又在暗中搞鬼？
苏御微微皱眉，轻声道：“林兄，看来咱们这趟江湖之行，不太平啊。”林羽站起身来，神色凝重：“不管怎样，先把这死者身份来历摸清，说不定能寻到些蛛丝马迹。”当下，二人向客栈老板和伙计打听死者的情况。那老板哭丧着脸，说道：“这镖师是个熟客，名叫赵勇，走南闯北多年，平日里话不多，昨晚投店时还一切正常，哪晓得今早就……”伙计也在一旁补充，说赵勇昨晚曾与人在大堂起了争执，不过声音不大，没听真切内容。
林羽和苏御顺着这条线索，在镇上四处寻访目击者。好不容易找到一位卖馄饨的老头，他回忆起昨晚之事，磕巴着说：“我瞅见那跟镖师吵架的，是个黑袍汉子，口音怪得很，眼睛绿油油的，透着股子狠劲，看着就不像好人。”林羽心中越发笃定这事儿与北漠脱不了干系，谢过老头后，二人决定在镇上多留几日，看看能否寻到那黑袍汉子的踪迹。
夜幕降临，飞云镇笼罩在一片静谧之中，林羽和苏御潜伏在镇口要道旁的屋顶，屏息以待。三更时分，一道黑影如鬼魅般闪过，林羽眼神一凛，与苏御默契十足地同时出手，从两侧包抄过去。黑影察觉到危险，身形一转，竟是个身形高大的黑袍人，月光下，那双眼睛泛着幽幽绿光，正是卖馄饨老头描述之人。黑袍人见势不妙，二话不说，抬手就是一阵毒针雨射向二人，林羽挥剑拨打，苏御则以太极剑圈出一片剑幕抵挡。趁这间隙，黑袍人转身欲逃，林羽大喝一声：“哪里走！”脚下轻点，如苍鹰扑食般追了上去。
几个起落间，林羽已拉近与黑袍人的距离，挺剑刺出，剑风呼啸。黑袍人侧身避开，反手拍出一掌，掌风带着股腥膻之气。林羽侧身一闪，借势贴近黑袍人，一招“清风破雾”直逼对方咽喉。黑袍人慌乱之下，从怀中掏出一物往地上一砸，瞬间浓烟滚滚，刺鼻难闻。林羽屏住呼吸，挥剑驱散浓烟，却发现黑袍人已没了踪影。
待与苏御会合，二人皆是一脸懊恼。回到客栈，林羽反复思索那黑袍人的武功路数，越发觉得诡异。第二日，他们继续在镇上排查，竟发现还有其他可疑人物在暗中窥探。这些人藏头露尾，一旦察觉林羽二人靠近，便迅速消失。正当他们毫无头绪之时，苏御忽然收到武当飞鸽传书，信上说近日武当山下也出现了类似的神秘人物，形迹可疑，似在找寻什么。林羽沉思片刻，说道：“看来这背后定是一场针对江湖的大阴谋，咱们得分头行事，你速回武当护山，我去联络其他门派，共商对策。”
苏御虽有些担忧林羽，但也知事不宜迟，当下点头同意，二人就此别过。林羽马不停蹄赶往峨眉，途中却遭遇一波又一波神秘杀手的阻拦。这些杀手武功参差不齐，却个个悍不畏死，所用招式繁杂怪异，既有中原武功的影子，又杂糅着北漠的狂野风格。林羽一路且战且走，身上添了不少伤口，好在他意志坚定，硬是突破重围，赶到了峨眉。
峨眉山上，静玄师太听闻林羽所言，神色凝重，立即召集门下弟子商议。与此同时，江湖各大门派也纷纷传来消息，皆遭遇了不同程度的骚扰与挑衅。一时间，江湖暗流涌动，人心惶惶。林羽深知，一场比与北漠大军正面交锋更为隐秘、凶险的危机正悄然降临，而他必须在这混沌局势中，找出幕后黑手，守护江湖安宁，就如同守护大明疆土一般，刻不容缓……