吕不韦的覆灭如同一次彻底的外科手术，割除了秦国肌体上最大的痼疾，但也带来了短暂的阵痛。秦王政六年至十年的这五年，嬴政并未急于挥师东出，而是将一种近乎冷酷的理性与高效，投入到了这台战争机器的全面改造与升级之中。这五年，没有震天的战鼓，没有遍地的烽烟，只有更深沉的谋划、更彻底的变革，以及一种山雨欲来前的、令人窒息的寂静。
亲政后的嬴政，展现出了与年龄不符的、对权力的绝对掌控欲。他并未因铲除吕不韦而松懈，反而以此为契机，对朝堂进行了一次彻底的清洗与重塑。
依据李斯整理的罪证，对吕不韦余党进行了持续而彻底的追查清算。此举不仅是为了报复，更是为了根除朝堂上任何可能存在的、非忠于他个人的势力集团。过程铁血无情，牵连者众，咸阳城的刑场在最初两年几乎未曾冷清过。此举极大地震慑了所有官员，确保了中央政令的绝对统一。
· 改革官制，强化集权： 削弱乃至虚化了部分可能对君权形成制约的职位，进一步强化丞相如王绾、隗状，国尉、御史大夫三公的权力，并使其直接向自己负责。重要决策，无论大小，皆由他最终裁定。他每日批阅的竹简重量以石计，勤政到了近乎自虐的程度。
·对有功之臣不吝赏赐，如李斯、蒙恬等人地位不断提升；但对于任何敢于挑战其权威或触犯秦法者，无论功劳多大，地位多高，惩处都极其严厉。
嬴政深知，战争拼的是综合国力。他将混沌珠赋予的数据处理能力和宏观视野，淋漓尽致地运用到了内政建设上。他下令在全国范围内进行了一次空前详细的人口、土地、牲畜、物资普查（“初令男子书年”），并建立了严格的年度上报与核查制度。通过这些精准的数据，他能够最有效地调配全国的人力、物力。哪里需要兴修水利，哪里需要储备粮草，哪里可以征发多少兵役，皆以此为依据。
他力排众议，继续支持韩国水工郑国主持修建那条后来以他名字命名的郑国渠。尽管最初这是韩国的“疲秦之计”，但嬴政以其超凡的眼光，看出了此渠对关中农业的巨大潜力。渠成之后，“溉泽卤之地四万余顷，收皆亩一钟”，关中成为真正的天府之国，为前线提供了源源不断的粮食保障。此事也体现了他不拘一格用人的魄力。
他颁布诏令，强制推行度量衡的标准器，结束战国以来“田畴异亩，车途异轨，律令异法，衣冠异制，言语异声，文字异形”的混乱局面。这不仅便于国家管理、税收征缴，更深层次的意义在于，从文化和社会生活层面，开始塑造一个“统一”的秦帝国认同，为未来的大一统奠定基础。李斯等人创制的小篆，也成为官方标准文字。
嬴政对秦军的改造，着眼于专业化、标准化和绝对的忠诚。继续严格执行商鞅建立的军功爵制，确保军队的上升渠道畅通和战斗力旺盛。同时，他更加注重对中下层军官和专业技术兵种（如弩兵、车兵、工程兵）的培养与提拔，使秦军的组织结构更加合理高效。
设立专门的“工室”和“武库”，由精通器械的官员负责，严格统一兵器、铠甲、战车、弩机的制式与质量标准。他鼓励对现有装备进行改进，例如对弩的射程与精度、剑的硬度与韧性提出更高要求。蒙恬等将领也在他的支持下，不断演练新的阵法与战术，以适应不同地形和敌情的需要。
设立“间使”，派遣大量精明强干之士，携带重金，潜入六国。他们的任务不仅是收集军事布防、山川地理等情报，更包括收买六国权臣、散布谣言、离间君臣，从内部瓦解敌人的抵抗意志。这笔庞大的“看不见的军费”，效果往往胜过十万大军。
这五年里，嬴政与混沌珠的融合更深。他花费大量时间，在脑海中和沙盘上进行无休止的战争推演。混沌珠不仅能帮他处理庞杂的军情数据，更能模拟出不同决策可能导致的连锁反应，甚至能模糊地“感知”到六国主要将领的性格特点、用兵习惯，以及各国朝堂上的权力斗争和民心向背。
他开始尝试一种更玄妙的运用——引导“势”。他通过精确的情报投放、恰到好处的外交施压（或安抚）、以及针对性的经济手段潜移默化地影响六国的决策，使其内部矛盾激化，或使其在关键时刻做出有利于秦国的选择。他像一位高明的棋手，不仅在布局自己的棋子，更在无形中影响着对手的落子。
到了秦王政十年，一切准备都已接近完成。以咸阳为中心，建立了覆盖全国、效率极高的驰道网络和粮草转运系统。在靠近前线的战略要地，如荥阳、野王等地，建立了巨大的物资储备基地。
经过无数次推演，最终确定了“远交近攻，先弱后强，中央突破，席卷天下”的总体战略。首要目标，锁定在相对弱小、且地处中原腹心、可切断南北联系的韩国。
王翦、蒙武等经验丰富的老将，以及蒙恬、王贲等锐气正盛的新生代将领，均已到位，各司其职。李斯等文臣则负责保障后方与外交斡旋。
秦王政十年冬，咸阳宫举行了一次最高级别的军事会议。嬴政站在那幅巨大的、标注着山东六国山川城邑的地图前，目光如炬。
他没有询问“该不该打”，而是直接指向地图上的新郑。
“五年蓄力，粮草丰足，甲兵犀利，法令通行。”
“寡人意已决，明年开春，兵出函谷，先取韩国，断山东之脊！”
他的声音不高，却带着一种不容置疑的决绝，仿佛已经看到了六国社稷在他脚下崩塌的景象。
殿内群臣，无论是老成持重的王翦，还是锐意进取的蒙恬，皆肃然躬身：
“臣等，谨遵王命！”
五年的沉寂与耕耘，终于到了收获的时刻。一台有史以来最精密、最冷酷、也最高效的战争机器，在秦王嬴政的意志驱动下，开始缓缓启动，它的齿轮，首先对准了孱弱的韩国。席卷天下的风暴，将从这里开始掀起第一片浪涛。